Abstract
В обзоре представлен сравнительный анализ протоколов электропорации, применяемых для генетической трансформации микромицетов. Особое внимание уделяется факторам, определяющим эффективность метода: физиологическому состоянию клеток, способам ослабления клеточной стенки, составу буфера и параметрам электрического импульса. На основе анализа литературы выделены как универсальные принципы, так и видоспецифичные этапы, требующие оптимизации. Рассмотрены перспективы применения электропорации для доставки компонентов систем редактирования генома (CRISPR-Cas9) и даны практические рекомендации по разработке и оптимизации протоколов для новых видов грибов
References
1. Balabanova, L. A., Shkryl, Y. N., Slepchenko, L. V., Yugay, Y. A., Gorpenchenko, T. Y., Kirichuk, N. N., Khudyakova, Y. V., Bakunina, I. Yu., Podvolotskaya, A. B., Bulgakov, V. P., Seitkalieva, A. V., Son, O. M., & Tekutyeva, L. A. (2019). Development of host strains and vector system for an efficient genetic transformation of filamentous fungi. Plasmid, 101, 1–9. https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2018.11.002
2. Bowman, S. M., & Free, S. J. (2006). The structure and synthesis of the fungal cell wall. BioEssays, 28(8), 799–808. https://doi.org/10.1002/bies.20441
3. Chakraborty, B. N., Patterson, N. A., & Kapoor, M. (1991). An electroporation-based system for high-efficiency transformation of germinated conidia of filamentous fungi. Canadian Journal of Microbiology, 37(11), 858–863. https://doi.org/10.1139/m91-147
4. de Groot, M. J., Bundock, P., Hooykaas, P. J., & Beijersbergen, A. G. (1998). Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of filamentous fungi. Nature Biotechnology, 16(9), 839–842. https://doi.org/10.1038/nbt0998-839
5. Gietz, R. D., & Woods, R. A. (2001). Genetic Transformation of Yeast. BioTechniques, 30(4), 816–831. https://doi.org/10.2144/01304rv02
6. Haberl Meglič, S., & Kotnik, T. (2016). Electroporation-Based Applications in Biotechnology. В D. Miklavcic (Ред.), Handbook of Electroporation (сс. 1–17). Springer International Publishing. https://doi.org/10.1007/978-3-319-
7. Kotnik, T., Frey, W., Sack, M., Haberl Meglič, S., Peterka, M., & Miklavčič, D. (2015). Electroporation-based applications in biotechnology. Trends in Biotechnology, 33(8), 480–488. https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2015.06.002
8. Kück, U., & Hoff, B. (2010). New tools for the genetic manipulation of filamentous fungi. Applied Microbiology and Biotechnology, 86(1), 51–62. https://doi.org/10.1007/s00253-009-2416-7
9. Meyer, V., Mueller, D., Strowig, T., & Stahl, U. (2003). Comparison of different transformation methods for Aspergillus giganteus. Current Genetics, 43(5), 371–377. https://doi.org/10.1007/s00294-003-0406-3
10. Nødvig, C. S., Nielsen, J. B., Kogle, M. E., & Mortensen, U. H. (2015a). A CRISPR-Cas9 System for Genetic Engineering of Filamentous Fungi. PLOS ONE, 10(7), e0133085. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0133085
11. Ozeki, K., Kyoya (Fujii), F., Hizume, K., Kanda, A., Hamachi, M., & Nunokawa, Y. (1994). Transformation of Intact Aspergillus niger by Electroporation. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 58(12), 2224–2227. https://doi.org/10.1271/bbb.58.2224
12. Ruiz-Diez, B. (2002). Strategies for the transformation of filamentous fungi. Journal of Applied Microbiology, 92(2), 189–195. https://doi.org/10.1046/j.1365-2672.2002.01516.x
13. Sánchez, O., & Aguirre, J. (1996). Efficient Transformation of Aspergillus nidulans by Electroporation of Germinated Conidia. Fungal Genetics Reports, 43(1), 48–51. https://doi.org/10.4148/1941-4765.1317
14. Ward, M., Kodama, K. H., & Wilson, L. J. (1989). Transformation ofAspergillus awamori andA. niger by electroporation. Experimental Mycology, 13(3), 289–293. https://doi.org/10.1016/0147-5975(89)90050-9
15. Weaver, J. C. (1995). Electroporation Theory Concepts and Mechanisms. В Methods in Molecular Biology (Humana Press Inc).

This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.